В 1990 году компания Clarins сподвигла Тьерри Мюглера, к тому моменту уже всемирно известного модельера, на выпуск парфюмерии. В том же году была создана марка Thierry Mugler Parfums (рус. - Тьерри Мюглер Парфам,) во главе которой встала Вера Штруби, бывшая манекенщица и фотомодель, впоследствии работавшая в YSL Parfums и в 1984 году возглавлявшая Montana Parfums. 

Именно с Верой Штруби Манфред Тьерри Мюглер создаёт один из самых известных в мире женских ароматов — Angel. Задавшая моду на гурманские ароматы сладко-пачулиевая бомба была выпущена в 1992 году. Флакон в виде звёзды из небесно-голубого стекла делали в старинной, появившейся ещё в 1854 году, стекольной мастерской Verreries Brosse, той самой, где был создан и флакон для Chanel №5. 

В 1996 году был выпущен «мужской ангел» — A*Men, а в 2001 — унисекс-аромат Cologne, в работе над которым впервые был задействован в качестве консультанта Пьер Олас, протеже Штруби, который затем станет постоянным ответственным за ароматы Mugler. Второй женский аромат — Alien — также созданный под руководством Оласа.  

Глубокий интерес Манфреда к спиртным напиткам отразился в нескольких проектах, где он пытался совместить парфюмерию с искусством виноделия: просуществовавшее с 2005 по 2011 год «Les Ateliers Parfums par Thierry Mugler»; проект 2007 года «La Part des Anges», в рамках которого Мюглер сотрудничал с домом Cognac Rémy Martin, — в результате этого сотрудничества было создано 4700 флаконов духов Angel, особенность которых заключалась в мацерации в бочках вишнёвого дерева; в 2009 году подобный эксперимент повторится с ароматами Angel, Alien и A*Men, которые будут выдержаны в деревянных бочках и выпущены затем под общим названием «Liqueurs de Parfum». 

В 2008 году выпускается коллекция из пяти ароматов Miroir Miroir. Ароматы пятерки созданы разными парфюмерами. 

В 2010 году, восьмого марта, был выпущен один из самых нестандартных ароматов дома — Womanity. 

Группа Clarins владеет правами на марку Thierry Mugler с 1997 года, и вплоть до 2013 Манфред Тьерри Мюглер принимал участие в работе над парфюмерией бренда, оставаясь креативным директором Thierry Mugler Parfums, хотя от работы над линией одежды он отошёл ещё в 2002 году. 

После ухода Манфреда Тьерри Мюглера с поста креативного директора название бренда с Thierry Mugler сменилось на MUGLER. 

В 2014 году, в рамках моды на выпуск «высоких» а-ля нишевых линеек, Mugler представили коллекцию Les Exceptions, к 2019 году насчитывающую уже 11 ароматов. Большинством парфюмерных критиков эта коллекция считается одной из самых удачных у люксовых брендов. 

В 2017 году марка представила аромат Aura, ставший родоначальником новой линейки. 

Рекламные кампании Mugler — футуристичные и фантастические — снимали, к примеру, сам Тьерри (первый ролик Angel) или автор "космических" клипов Muse Флория Сигизмонди (видео Alien), а лицами ароматов в разное время были фотомодель и актриса Джерри Холл, актриса Ева Мендес, модель Джорджия Мэй Джаггер, актриса Наоми Уоттс, бегун-паралимпиец Оскар Писториус, модель Женя Катава.