В 1993 году молодой американский модный дизайнер Марк Джейкобс и его бизнес партнёр Роберт Даффи зарегистрировали Marc Jacobs International Company L.P. (основан бренд был ещё в 1984 году).

Парфюмерная линейка Marc Jacobs появилась в начале 2000-х. Первый аромат Marc Jacobs Eau de Parfum вышел в 2001 году при поддержке компании American Designer Fragrances, созданным в 1999 году подразделением Givenchy, принадлежащим родительскому концерну LVMH (с 1997 по 2014 год Джейкобс был креативным директором Louis Vuitton, потому не удивительно, что он воспользовался базой компании для выпуска парфюмерии под собственным брендом). 

В 2003 году лицензия на производство парфюмерии Marc Jacobs отошла к Coty. Первый аромат с новым лицензиатом — белоцветочный Blush — вышел в 2004 году. В 2006-м были выпущены первые ароматы коллекции Splash — лёгких моно-ароматов, замечательных своими 300-миллилитровыми флаконами. 

В 2019 году Marc Jacobs и Coty продлили контракт, подписанный более десяти лет назад. За годы сотрудничества под брендом Marc Jacobs были выпущены коллекции ароматов Lola, Dot, Bang, Décadence и суперуспешная Daisy, насчитывающая более сорока фланкеров.